В ночь на 3 июня губернатор Ленинградской области сообщил о налёте украинских беспилотников на регион. Атаки продолжались примерно с двух до семи часов утра; по словам главы региона, за это время было сбито около 50 дронов. О подробностях последствий для населённых пунктов в области официально не сообщалось.
В Санкт‑Петербурге были слышны взрывы в нескольких районах города. В Кировском районе в результате падения дронов загорелся «Петербургский нефтяной терминал» — один из крупнейших нефтеперевалочных комплексов на Балтике с пропускной способностью порядка 12,5 млн тонн в год и 21 резервуаром для хранения нефтепродуктов; предприятие имеет стратегическое значение.
Атака совпала с началом Петербургского международного экономического форума, который проходит с 3 по 6 июня. Вследствие налёта в аэропортовом узле Пулково была задержана большая часть рейсов — более двух десятков вылетов.
Также в ночь на 3 июня под ударом оказался город Мичуринск в Тамбовской области: в результате падения беспилотников повреждены многоквартирный дом, библиотека и школа искусств (выбиты стекла), а также хозяйственные постройки промышленного предприятия. По информации региональных властей, пострадавших нет.
Сообщается, что одной из целей стала производственная площадка, выпускающая оборудование для систем управления авиационной и ракетной техникой; это предприятие уже подвергалось ударам ранее.
По данным Минобороны РФ, за ночь было сбито около 354 беспилотников. Системы ПВО отражали атаки над несколькими регионами — всего перехваты фиксировались более чем в десятке областей, в том числе в Белгородской, Брянской, Воронежской, Калужской, Курской, Ленинградской, Новгородской, Орловской, Ростовской, Тульской и Московской областях. Накануне и в ночь на 3 июня Росавиация ограничивала работу ряда аэропортов, включая московские узлы и несколько региональных авиагаваней.